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Comparative assessment of the intragenomic variations of dinoflagellate
Tripos
species through single-cell sequencing
期刊论文
MARINE POLLUTION BULLETIN, 2024, 卷号: 206, 页码: 12
作者:
Huang, Xianliang
;
Li, Yingchao
;
Du, Haina
;
Chen, Nansheng
收藏
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浏览/下载:56/0
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提交时间:2024/09/02
Tripos
Single cell analysis
Intra-genomic variations (IGVs)
Molecular diversity
Metabarcoding
Chromosome-level genome assembly of marine diatom
Skeletonema tropicum
期刊论文
SCIENTIFIC DATA, 2024, 卷号: 11, 期号: 1, 页码: 10
作者:
Liu, Shuya
;
Chen, Nansheng
收藏
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浏览/下载:7/0
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提交时间:2024/08/29
Dinoflagellate
Tripos
species composition and seasonal dynamics in Jiaozhou Bay revealed through 18S rDNA V4-based metabarcoding analysis
期刊论文
JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY, 2024, 页码: 14
作者:
Huang, Xianliang
;
Liu, Kuiyan
;
Ding, Xiangxiang
;
Liu, Shuya
;
Cui, Zhongmei
;
Zhao, Yongfang
;
Chen, Nansheng
收藏
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浏览/下载:34/0
  |  
提交时间:2024/08/29
Tripos
Harmful algal bloom
Composition
Spatiotemporal
Molecular marker
Metabarcoding
Extensive intragenomic variations of the 18S rDNA V4 region in the toxigenic diatom species
Pseudo-nitzschia
multistriata revealed through high-throughput sequencing
期刊论文
MARINE POLLUTION BULLETIN, 2024, 卷号: 201, 页码: 11
作者:
Wang, Hui
;
Liu, Kuiyan
;
Chen, Ziyan
;
Chen, Yang
;
Hu, Zhangxi
;
Chen, Weizhou
;
Leaw, Chui Pin
;
Chen, Nansheng
收藏
  |  
浏览/下载:41/0
  |  
提交时间:2024/08/29
Metabarcoding analysis
Pseudo-nitzschia multistriata
Molecular markers polymorphism
SSU rDNA
Intragenomic variations (IGVs)
The high molecular diversity in Noctiluca scintillans is dominated by intra-genomic variations revealed by single cell high-throughput sequencing of 18S rDNA V4
期刊论文
HARMFUL ALGAE, 2024, 卷号: 132, 页码: 10
作者:
Liu, Kuiyan
;
Huang, Xianliang
;
Ding, Xiangxiang
;
Chen, Nansheng
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浏览/下载:126/0
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提交时间:2024/04/07
Noctiluca scintillans
Single cell analysis
Molecular diversity
Inter -species diversity
Intra -species diversity
Chromosome-level genome assembly of the Pacific geoduck
Panopea generosa
reveals major inter- and intrachromosomal rearrangements and substantial expansion of the copine gene family
期刊论文
GIGASCIENCE, 2023, 卷号: 12, 页码: 13
作者:
Wang, Jing
;
Xu, Qing
;
Chen, Min
;
Chen, Yang
;
Wang, Chunde
;
Chen, Nansheng
收藏
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浏览/下载:34/0
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提交时间:2024/06/04
Panopea generosa
chromosome-level genome assembly
genetic breeding
evolutionary adaptation
New record of the feather star
Palaeocomatella hiwia
(Echinodermata: Crinoidea: Comatulida) from Zhenbei Seamount in South China Sea: new insights into the taxonomic position of
Palaeocomatella
期刊论文
JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2023, 页码: 8
作者:
Sun, Shao'e
;
Mei, Zijie
;
Sha, Zhongli
;
Wang, Jing
;
Chen, Nansheng
Adobe PDF(5219Kb)
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收藏
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浏览/下载:124/1
  |  
提交时间:2024/04/07
new record
Palaeocomatella hiwia McKnight, 1977
South China Sea
phylogenetic relationship
taxonomy
Expansion of photoreception-related gene families may drive ecological adaptation of the dominant diatom species Skeletonema marinoi
期刊论文
SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 2023, 卷号: 897, 页码: 12
作者:
Liu, Shuya
;
Xu, Qing
;
Chen, Nansheng
Adobe PDF(4070Kb)
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浏览/下载:143/0
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提交时间:2023/12/13
Comparative genomics
Skeletonema marinoi
Coastal dominant diatom
Photoreception-related gene families
Chromosome-level genome
Evolutionary dynamics of plastomes in coscinodiscophycean diatoms revealed by comparative genomics
期刊论文
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2023, 卷号: 14, 页码: 13
作者:
Liu, Feng
;
Wang, Yichao
;
Huang, Hailong
;
Chen, Nansheng
收藏
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浏览/下载:120/0
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提交时间:2023/12/07
diatom
plastome
Coscinodiscophyceae
gene duplication
inverted repeats
phylogenomic analysis
Genetic Diversity and Geographical Distribution of the Red Tide Species Coscinodiscus granii Revealed Using a High-Resolution Molecular Marker
期刊论文
MICROORGANISMS, 2022, 卷号: 10, 期号: 10, 页码: 14
作者:
Huang, Hailong
;
Xu, Qing
;
Song, Huiyin
;
Chen, Nansheng
Adobe PDF(8189Kb)
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收藏
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浏览/下载:162/0
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提交时间:2023/01/04
red tide species
Coscinodiscus granii
mitochondrial genomes (mtDNAs)
molecular marker
genetic diversity