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日本鳗鲡(Anguilla japonica)群体遗传结构及本地适应性机制研究初探 学位论文
, 北京: 中国科学院大学, 2017
作者:  于磊
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日本鳗鲡  群体遗传结构  本地适应性  微卫星  单核苷酸位点多态性  
中国近海小黄鱼SNP标记开发及种群基因组学研究 学位论文
, 北京: 中国科学院大学, 2016
作者:  张柏东
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小黄鱼  单核苷酸多态性标记  Rad-seq  群体遗传结构  本地适应性  种群基因组学  
文蛤弧菌抗性相关标记/基因的确定及遗传互作效应分析 学位论文
, 北京: 中国科学院大学, 2015
作者:  聂庆
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文蛤  弧菌抗性  微卫星  单核苷酸多态性  标记-性状关联分析  多毛蛋白  Dna分化抑制因子2  
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)高通量转录组解析及免疫通路关键基因筛选 学位论文
, 北京: 中国科学院研究生院, 2014
作者:  李希红
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中华绒螯蟹  肝胰腺和幼体  转录组  免疫通路基因  单核苷酸多态性  
进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201310340730.1, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
发明人:  于洋;  李富花;  张晓军;  相建海
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进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系  包括多重微卫星引物体系  其特征在于:使用多态性高的lvm1‑lvm15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系  所述的两个多重微卫星引物体系如下:1)多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为:lvm1f:6‑fam(羧基荧光素)‑5’‑gatgacctgcctttctctgc‑3’lvm1r:5’‑gggagagatgatgggaagaag‑3’lvm2f:Rox(羧基x罗丹明)‑5’‑atggcacaaataggatcttg‑3’lvm2r:5’‑gactggaagagcactgattc‑3’lvm3f:Hex(六氯荧光素)‑5’‑atacgaaacaccccatccc‑3’lvm3r:5’‑gtggtcttacctcgtggctc‑3’lvm4f:Tamra(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑agcacctagcacttgctgaac‑3’lvm4r:5’‑agagactcacatcctcatcctc‑3’lvm5f:6‑fam(羧基荧光素)‑5’‑cattgaaaacggaatcctcg‑3’lvm5r:5’‑gatattcccatcaacacagcg‑3’lvm6f:Rox(羧基x罗丹明)‑5’‑caccaaaacgaacgaaacg‑3’lvm6r:5’‑ggataaaaacgaattgtataccg‑3’lvm7f:Hex(六氯荧光素)‑5’‑gagagcaaataagaaagggc‑3’lvm7r:5’‑aggatgcaaatgataacgag‑3’lvm8f:Tamra(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑ggcacactgtttagtcctcg‑3’lvm8r:5’‑cgaacagaatggcagaggag‑3’lvm9f:6‑fam(羧基荧光素)‑5’‑cccgacttggcttttagttg‑3’lvm9r:5’‑gagattgctatcctcggctg‑3’lvm10f:Rox(羧基x罗丹明)‑5’‑gatcctgcgagtcactttatctc‑3’lvm10r:5’‑tttattgcgtatcccagaagc‑3’2)多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下:lvm11f:6‑fam(羧基荧光素)‑5’‑ccgccatcatcatcaaca‑3’lvm11r:5’‑tcattcgggttcgagactc‑3’lvm12f:Rox(羧基x罗丹明)‑5’‑gatcattcgcccctcttttt‑3’lvm12r:5’‑atctacggttcgagagcaga‑3’lvm13f:Hex(六氯荧光素)‑5’‑ggactcacacttctggttc‑3’lvm13r:5’‑ggctgcaccttgtaagtc‑3’lvm14f:Tamra(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑tatgctcgttccctttgctt‑3’lvm14r:5’‑ttgaaggaaaagtgttgggg‑3’lvm15f:6‑fam(羧基荧光素)‑5’‑actagtggatctgtctattcat‑3’lvm15r:5’‑atacccacccatgcatgtta‑3’。  
文蛤微卫星标记的检测方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
发明人:  刘保忠;  卢霞;  王鸿霞
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文蛤微卫星标记的检测方法  其特征在于:首先利用文蛤est序列获取微卫星标记的微卫星核心序列  所述特异性引物为正链:5’?tcccaggaacgattgttagg?3’  并在其序列两端设计特异性引物并进行pcr扩增  负链:5’?agcattcacgacaccaacat?3’。  对pcr产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测  从而检测文蛤个体的基因型  及在此微卫星位点的遗传变异  获得文蛤该位点的遗传多态性图谱  
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
发明人:  卢霞;  王鸿霞;  刘保忠
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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法  gc含量为40%?60%  包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系  2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件primer?premier?5.0设计引物  退火温度为45?65℃  其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组dna利用提取的dna  引物设计条件为:引物长度为19?25mer  预期pcr产物长度为100?400bp  采用限制性内切酶法获得文蛤基因组dna片段  并构建微卫星磁珠富集文库  检测阳性克隆  3)引物优化:根据不同引物的tm值进行温度梯度优化  经测序得到含有微卫星重复的dna序列  在tm值上下各10℃  4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)衡量  温度梯度优化扩增得到的pcr产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?eb染色系统进行检测  根据上述优化获得的ta值  选取杂带较少、特异性产物亮度较高的pcr反应对应的温度为该引物的最佳退火温度ta  选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)进而衡量多态性信息  根据pic值  Pic小于0.25的标记  筛选得到重复性好、稳定性好  Pic值大于0.25的位点  作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系  用于文蛤的家系区分与个体识别。  
扇贝耐热性状候选基因的多态性及其作用机制研究 学位论文
: 中国科学院研究生院, 2012
作者:  杨传燕
Adobe PDF(2984Kb)  |  收藏  |  浏览/下载:241/1  |  提交时间:2014/08/08
扇贝  基因多态  单核苷酸多态性  耐热性状  分子标记  
免疫相关基因多态与扇贝抗病性的关联分析 学位论文
: 中国科学院研究生院, 2012
作者:  VINU SUBBAYYAPILLAI SIVATHANUPILLAI
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栉孔扇贝  海湾扇贝  单核苷酸多态性  抗病  感病  
栉孔扇贝(Chlamys farreri)BAC末端序列中SSR和SNP分子标记的开发及初步应用研究 学位论文
: 中国科学院研究生院, 2012
作者:  张秀英
Adobe PDF(2567Kb)  |  收藏  |  浏览/下载:336/0  |  提交时间:2014/08/08
栉孔扇贝(chlamys Farreri)  Bac末端序列(bess)  分子标记  简单重复序列(ssr)  单核苷酸多态性(snp)