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The impact of selection on population genetic structure in the clam Meretrix petechialis revealed by microsatellite markers 期刊论文
GENETICA, 2016, 卷号: 144, 期号: 1, 页码: 1-8
作者:  Lu, Xia;  Wang, Hongxia;  Li, Yan;  Liu, Baozhong
Adobe PDF(645Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：362/2  |  提交时间：2016/05/03
Mass Selection  Meretrix Petechialis  Microsatellite  Population Genetic Structure  Temporal Genetic Variation  
Characterization of a long-chain fatty acid-CoA ligase 1 gene and association between its SNPs and growth traits in the clam Meretrix meretrix 期刊论文
GENE, 2015, 卷号: 566, 期号: 2, 页码: 194-200
作者:  Dai, Ping;  Huan, Pin;  Wang, Hongxia;  Lu, Xia;  Liu, Baozhong
Adobe PDF(1588Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：334/0  |  提交时间：2015/07/27
Acsl1  Meretrix Meretrix  Starvation  Growth  Snps  
Three EST-SSR Markers Associated with QTL for the Growth of the Clam Meretrix meretrix Revealed by Selective Genotyping 期刊论文
MARINE BIOTECHNOLOGY, 2013, 卷号: 15, 期号: 1, 页码: 16-25
作者:  Lu, Xia;  Wang, Hongxia;  Liu, Baozhong;  Xiang, Jianhai;  Liu, BZ
Adobe PDF(218Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：279/1  |  提交时间：2014/07/17
Meretrix Meretrix  Est-ssr  Qtl  Selective Genotyping  Marker-trait Association  
文蛤微卫星标记的检测方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
发明人:  刘保忠;  卢霞;  王鸿霞
Adobe PDF(463Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：281/0  |  提交时间：2014/08/04
文蛤微卫星标记的检测方法  其特征在于：首先利用文蛤est序列获取微卫星标记的微卫星核心序列  所述特异性引物为正链：5’?tcccaggaacgattgttagg?3’  并在其序列两端设计特异性引物并进行pcr扩增  负链：5’?agcattcacgacaccaacat?3’。  对pcr产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测  从而检测文蛤个体的基因型  及在此微卫星位点的遗传变异  获得文蛤该位点的遗传多态性图谱  
The role of catalase in the immune response to oxidative stress and pathogen challenge in the clam Meretrix meretrix 期刊论文
FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY, 2013, 卷号: 34, 期号: 1, 页码: 91-99
作者:  Wang, Chao;  Yue, Xin;  Lu, Xia;  Liu, Baozhong;  Liu, BZ
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Meretrix Meretrix  Cat  Redox Balance  Oxidative Stress  Vibrio Parahaemolyticus  
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
发明人:  卢霞;  王鸿霞;  刘保忠
Adobe PDF(798Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：297/0  |  提交时间：2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法  gc含量为40％?60％  包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系  2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件primer?premier?5.0设计引物  退火温度为45?65℃  其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组dna利用提取的dna  引物设计条件为：引物长度为19?25mer  预期pcr产物长度为100?400bp  采用限制性内切酶法获得文蛤基因组dna片段  并构建微卫星磁珠富集文库  检测阳性克隆  3)引物优化：根据不同引物的tm值进行温度梯度优化  经测序得到含有微卫星重复的dna序列  在tm值上下各10℃  4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)衡量  温度梯度优化扩增得到的pcr产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?eb染色系统进行检测  根据上述优化获得的ta值  选取杂带较少、特异性产物亮度较高的pcr反应对应的温度为该引物的最佳退火温度ta  选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)进而衡量多态性信息  根据pic值  Pic小于0.25的标记  筛选得到重复性好、稳定性好  Pic值大于0.25的位点  作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系  用于文蛤的家系区分与个体识别。  
分子标记应用于文蛤遗传评价、图谱构建及QTL筛选的研究 学位论文
: 中国科学院研究生院, 2012
作者:  卢霞
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文蛤  分子标记  遗传监控  关联分析  遗传图谱  Qtl定位  
Microsatellite-based genetic and growth analysis for a diallel mating design of two stocks of the clam, Meretrix meretrix 期刊论文
AQUACULTURE RESEARCH, 2012, 卷号: 43, 期号: 2, 页码: 260-270
作者:  Lu, Xia;  Wang, Hongxia;  Liu, Baozhong;  Lin, Zhihua;  Liu, BZ (reprint author), Chinese Acad Sci, Inst Oceanol, Key Lab Expt Marine Biol, Qingdao 266071, Peoples R China.
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Microsatellite  Meretrix Meretrix  Reciprocal Cross  Heterosis  Maternal Effect  
Characterization of EST-SSR and genomic-SSR markers in the clam, Meretrix meretrix 期刊论文
CONSERVATION GENETICS RESOURCES, 2011, 卷号: 3, 期号: 4, 页码: 655-658
作者:  Lu, Xia;  Wang, Hongxia;  Dai, Ping;  Liu, Baozhong
Adobe PDF(145Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：279/0  |  提交时间：2012/07/03
Est-ssr  Genomic-ssr  Microsatellite  Clam  Meretrix Meretrix  
An effective method for parentage determination of the clam (Meretrix meretrix) based on SSR and COI markers 期刊论文
AQUACULTURE, 2011, 卷号: 318, 期号: 1-2, 页码: 223-228
作者:  Lu, Xia;  Wang, Hongxia;  Liu, Baozhong;  Xiang, Jianhai
Adobe PDF(712Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：496/1  |  提交时间：2012/07/03
Microsatellite Marker  Mitochondrial Cytochrome Oxidase (Coi)  Meretrix Meretrix  Parentage Determination