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家马核基因组中线粒体核内插入序列分析 | |
姜枫; 苗永旺; 刘斌; 申欣; 任建峰; 何帆 | |
发表期刊 | 动物学研究
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ISSN | 0254-5853 |
2008-12-15 | |
出版年 | 2008 |
卷号 | v.29期号:06页码:3-10 |
文献类型 | CNKI期刊论文 |
摘要 | 在各种真核生物核基因组中,存在一些由线粒体基因组转移进入核基因组中的DNA片段,这些被认为是分子化石的片段叫做线粒体核内插入序列(Numt)。由于Numt与真实的线粒体序列高度相似,因此它的存在必然会成为PCR扩增线粒体DNA的不利因素。利用已经公布的家马(Equus caballus)基因组序列(2007年9月公布,GenBank登录号为NC_009144-NC_009175)对家马Numt进行了深入分析,共发现200个可能的Numt,长度范围为29到3727bp,其中有10个的长度大于800bp。分析结果显示由于不存在线粒体控制区域的疑似Numt,因此对基于此区域的群体遗传学研究不会产生影响。本研究还发现在家马进化过程中,第1号和27号染色体更倾向于接受线粒体序列的转移。以上结果将为今后马科动物的研究提供重要的参考信息,有助于避免在线粒体DNA研究中由于Numt污染的存在而得出错误的实验结果。 |
关键词 | 线粒体DNA 核内插入序列 Numt 家马 假基因 |
CNKI专辑号 | A;D; |
CNKI专辑名称 | 基础科学;农业科技; |
CNKI专题号 | D050; |
CNKI专题名称 | 畜牧与动物医学; |
分类号 | S821 |
收录类别 | 北大核心 ; 中科院核心 |
语种 | 中文; |
资助项目(基金) | 国家自然科学基金项目(30660024) ; 云南省应用基础研究重点项目(2007C0003Z) ; 云南省应用基础研究计划面上项目(2006C0034M) |
文献类型 | CNKI期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/192763 |
专题 | 中国科学院海洋研究所 |
作者单位 | 1.云南农业大学动物科学技术学院 2.中国科学院北京基因组研究所 3.云南大学云南省生物资源保护与利用重点实验室 4.中国科学院海洋研究所 5.淮海工学院海洋学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 姜枫,苗永旺,刘斌,等. 家马核基因组中线粒体核内插入序列分析. 2008. |
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