逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子分析

IOCAS-IR

	逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子分析
	李娟 ; 李莉 ; 张国范
发表期刊	海洋科学
ISSN	1000-3096
	2013-02-15
出版年	2013
卷号	v.37;No.284 期号:02 页码:3-8
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	根据海湾扇贝(Argopecten irradians)过氧化物还原酶V(AiPrxV)的cDNA序列和部分基因组DNA序列设计引物,采用基因组步移方法扩增获得其第1内含子(I1)完整序列,并通过Blast比对、DNAMAN和RepFind搜索进行序列分析。AiPrxV I1长8 565bp,占AiPrxV基因全长的68%,AT%显著高于GC%。在5 900-6 700bp的区域中包含了不完整的编码区,经分析与文昌鱼、海胆的逆转录酶有极高的相似性,其N端与多种动植物逆转座子的逆转录酶C端具有相似特征。此外,发现AiPrxV I1中包含283个重复序列,在3 500-4 000bp和6 800-7 200bp区域尤为密集。以上特点提示海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子可能是由一个非长末端重复元件逆转座子(non-LTR retrotransposons)插入,逐渐演变而形成的。
关键词	海湾扇贝(Argopectenirradians) 过氧化物还原酶V 内含子逆转座子非长末端重复元件
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家公益性行业(农业)科研专项(3-35) ; 国家自然科学基金项目(30800842) ; 国家高技术研究发展计划项目(863计划,2010AA10A401)
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190981
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院研究生院
推荐引用方式 GB/T 7714	李娟,李莉,张国范. 逆转座子序列插入——海湾扇贝过氧化物还原酶V第1内含子分析. 2013.