基于16s rRNA基因片段的长臂虾科系统发育初步研究

IOCAS-IR

	基于16s rRNA基因片段的长臂虾科系统发育初步研究
	甘志彬 ; 李新正
发表期刊	海洋科学
ISSN	1000-3096
	2014-07-15
出版年	2014
卷号	v.38;No.301 期号:07 页码:9-15
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	长臂虾科(Caridea:Palaemonidae)是真虾类中最大的科级单元之一,为了探索长臂虾科内部的系统演化关系,作者采用从Genbank中下载的长臂虾科两亚科(Palaemoninae,Pontoniinae)14属30种长臂虾的线粒体16s rRNA基因序列片段,以鼓虾科(Alpheidae)细足鼓虾(Alpheus gracilipes)为外群分析长臂虾亚科和隐虾亚科之间的系统发育关系。在获得的466个序列位点中,变异位点263个,简约信息位点213个。DNA序列分析显示,隐虾亚科的德曼隐虾属(Manipontonia)与长臂虾亚科的遗传距离(0.211)要小于其与所在亚科的遗传距离(0.245);此属在基于贝叶斯法(BI)和邻接法(NJ)构建的系统发育树中也与长臂虾亚科的种属聚合为一支,然后与隐虾亚科种属聚合的一支成为姊妹群。结合此属与长臂虾亚科尾瘦虾属(Urocaridella)形态相似的特征,建议对德曼隐虾属在长臂虾科中的分类地位进行重新评估。除隐虾亚科德曼隐虾属聚合到长臂虾亚科聚类簇外,两亚科所属的其他种属各自聚合为一支,在系统树中互为姊妹群,支持将长臂虾分为两亚科的分类系统。
关键词	长臂虾科(Palaemonidae) 分子系统发育 16s rRNA基因
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家自然科学基金面上资助项目(41376163)
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190406
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所 2.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	甘志彬,李新正. 基于16s rRNA基因片段的长臂虾科系统发育初步研究. 2014.