基于三代测序技术的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高通量候选基因关联分析方法的建立

IOCAS-IR

	基于三代测序技术的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高通量候选基因关联分析方法的建立
	李碧瀚; 于洋 ; 刘桂嘉 ; 罗正 ; 李富花
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2021-09-15
出版年	2021
卷号	v.52 期号:05 页码:193-202
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)是世界也是我国的主导对虾养殖品种,产业的发展离不开良种的支撑,分子育种被认为是加快良种选育的最有效途径,而目标性状相关分子标记的开发是发展分子育种的基础。研究主要目的是建立一种适用于凡纳滨对虾等水产经济物种的高通量候选基因关联分析方法,并在抗弧菌相关标记筛选中进行应用。首次将三代靶向测序技术用于对虾候选基因的基因分型,在抗弧菌性状候选基因LvPI3K的全长序列上发掘到91个SNP位点,通过关联分析鉴定到21个与抗弧菌性状显著相关的SNP标记(P<0.05),利用Sanger测序证实了三代靶向测序技术分型结果准确可靠。所建立的基于三代测序的靶向分型方法为凡纳滨对虾等水产动物提供了一种高效、低成本的基因分型方法,所发掘的抗弧菌性状相关位点对开展凡纳滨对虾抗弧菌性状分子育种具有一定指导意义。
关键词	三代靶向测序基因分型抗弧菌性状关联分析凡纳滨对虾
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家重点研发计划,2018YFD0901301号,2018YFD0900303号 ; 中国科学院战略性先导专项,XDA24030105号
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187645
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	李碧瀚,于洋,刘桂嘉,等. 基于三代测序技术的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高通量候选基因关联分析方法的建立. 2021.