黄海沉积物柱状样中有孔虫古DNA的提取和PCR扩增的方法学初探

doi:10.16087/j.cnki.1000-0674.2022.01.001

IOCAS-IR

	黄海沉积物柱状样中有孔虫古DNA的提取和PCR扩增的方法学初探
	法文龙 ; 李浩天 ; 李青霞 ; 类彦立; 李铁刚
发表期刊	微体古生物学报
ISSN	1000-0674
	2022-03-15
出版年	2022
卷号	v.39 期号:01 页码:74-88
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	海洋沉积物柱状样有孔虫古DNA是近年来国际新兴的研究技术,对于解释海洋全球变化可以获取到传统形态学检获不到的遗传信息,并对其进行比较和补充。目前国际上有孔虫古DNA的研究主要开展于深海和极地等有利于DNA保存的环境,但对于近海陆架海域尚无相关有效的技术研究。为了探索适合提取和扩增陆架浅海环境沉积物柱状样中的有孔虫古DNA的方法,本实验以采自山东半岛附近的黄海沉积物柱状样为研究对象,通过改进DNA提取过程的涡旋震荡时间和洗脱液体积、比较不同的PCR扩增条件和引物对,对陆架浅海地区沉积物柱状样中有孔虫古DNA提取和PCR扩增的方法进行了探索。借助ImageJ软件对PCR产物的凝胶电泳图像进行了定量分析与比较。研究结果显示,延长涡旋震荡时间和减少洗脱液体积可以提高对海洋沉积物环境总古DNA的提取效能,使用引物对s14F0和s15以及优化后的PCR条件能成功扩增陆架浅海环境沉积物中的有孔虫古DNA。本文探索了适用于陆架浅海环境沉积物柱状样的有孔虫古DNA的研究技术,可为古海洋和古环境研究提供新的研究思路。
关键词	古DNA PCR优化陆架浅海古海洋方法学分子生物学
CNKI专辑号	A;
CNKI专辑名称	基础科学;
CNKI专题号	A006;A011;
CNKI专题名称	生物学;地质学;
分类号	Q915
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
DOI	10.16087/j.cnki.1000-0674.2022.01.001
资助项目(基金）	国家自然科学基金项目(No.U1906211) ; 青岛海洋科学与技术试点国家实验室“问海计划”(2021WHZZB0804) ; 全球变化与海气相互作用专项(GASI-GEOGE-04) ; 山东省泰山学者工程专项经费资助(批准号:TS20190963)支持~~
引用统计
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187486
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室 2.中国科学院大学 3.中国科学院海洋大科学研究中心 4.自然资源部第一海洋研究所海洋沉积与环境地质重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	法文龙,李浩天,李青霞,等. 黄海沉积物柱状样中有孔虫古DNA的提取和PCR扩增的方法学初探. 2022.