Knowledge Management System Of Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences
| 稀有OTU对海洋底栖纤毛虫群落异质性的影响研究 | |
张越; 赵峰; 孙梦岩; 李玉全; 徐奎栋
| |
| 发表期刊 | 海洋科学
 |
| ISSN | 1000-3096 |
| 2022-12-15 | |
| 出版年 | 2022 |
| 卷号 | v.46;No.402期号:12页码:22-32 |
| 文献类型 | CNKI期刊论文 |
| 摘要 | 运用高通量测序技术分析微型生物多样性时,生物学重复间常表现出明显的异质性,这可能是高比例的稀有可操作分类单元(operated taxonomic unit, OTU)造成的“假象”。为明晰陆架海区站位间及同一站位重复间底栖纤毛虫群落的异质性水平,并探明稀有OTU与群落异质性的关系,给出去除稀有OTU阈值的科学建议。本研究在东海选取具有明显环境梯度的4个站位,每站位采集3个重复沉积物,采用高通量测序技术研究纤毛虫群落与分布。研究表明同一站位重复间群落不相似度在30%～34%,重复间群落的高差异性会掩盖地理距离较近的站位间差异(33%)。各个站位重复间共有OTU分别占该站位检获的总OTU数的34.4%, 31.9%, 39.5%和36.5%,而序列数基本占据94%以上。相对丰度小于0.1%的OTU占总OTU数的80%。依次去除相对丰度低于0.01%至0.1%的OTU,发现去除稀有OTU能够有效降低重复间差异,去除越稀有的OTU,降低效果越强;对站位之间的差异影响较小,且站位差异越大影响越小。稀有OTU的分布随机性极强,基本与站位无关。相对丰度低于0.015%的OTU是造成重复间群落异质性的主要原因,去除该部分OTU可更真实地展现底栖纤毛虫的群落异质性。 |
| 关键词 | 海洋底栖纤毛虫 异质性 分子多样性 DNA高通量测序 稀有OTU |
| CNKI专辑号 | A; |
| CNKI专辑名称 | 基础科学; |
| CNKI专题号 | A006; |
| CNKI专题名称 | 生物学; |
| 分类号 | Q178 |
| 收录类别 | 北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展 |
| 语种 | 中文; |
| 资助项目(基金） | 国家自然科学基金资助项目(41876171)~~ |
| 文献类型 | CNKI期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187237 |
| 专题 | 中国科学院海洋研究所 |
| 作者单位 | 1.青岛农业大学 2.中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室 3.中国科学院大学 4.中国科学院海洋大科学研究中心 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张越,赵峰,孙梦岩,等. 稀有OTU对海洋底栖纤毛虫群落异质性的影响研究. 2022. |
| 条目包含的文件 | 条目无相关文件。 | |||||
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