文蛤属(Meretrix)16S rRNA基因及ITS1序列的系统学分析

IOCAS-IR

	文蛤属(Meretrix)16S rRNA基因及ITS1序列的系统学分析
	潘宝平 ; 吴琪 ; 张素萍 ; 宋林生 ; 卜文俊
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2006-07-30
出版年	2006
期号	04 页码:56-61
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	利用线粒体16SrRNA基因片段及核糖体DNA转录间隔区ITS1序列分析的方法,以近缘属的青蛤(Cyclinasinensis)为外群,对文蛤属的文蛤(M.meretrix)、丽文蛤(M.lusoria)、帘文蛤(M.lyrata)和斧文蛤(M.lamarckii)4种贝类进行了系统学研究。经ClustalX多重比对及DNAsp软件分析后,用PAUP4.0分析软件,计算出种间序列的碱基转换/颠换频率,利用邻接法NJ构建系统发育树。结果表明,帘文蛤与该属其他三种的分歧时间较早,两类序列与其他种类间的相对遗传距离分别在0.25866—0.28218和0.15644—0.20104之间。文蛤与丽文蛤间的16SrDNA及ITS1序列间的遗传距离仅为0.04805和0.04201,拓扑结构图显示关系很近,并且二者的分布区大面积重叠,其序列间的转换/颠换频率接近种内单元型(haplotype)间的序列变化,鉴于它们的贝壳形态有一定差别,应归为同一个种内的不同地理亚种比较恰当。
关键词	文蛤属文蛤丽文蛤 16SrRNA基因 ITS1 分子系统学
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;A006;
CNKI专题名称	水产和渔业;生物学;
分类号	Q951;S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心
语种	中文;
资助项目(基金）	天津市高等学校科技发展项目资助,020801号 ; 国家基础科学人才培养基金资助,国科金发计字108号
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/198616
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.天津师范大学化学与生命科学学院 2.南开大学生命科学学院天津300071 3.中国科学院海洋研究所 4.南开大学生命科学学院天津300074 5.天津300074 6.青岛266071 7.天津300071
推荐引用方式 GB/T 7714	潘宝平,吴琪,张素萍,等. 文蛤属(Meretrix)16S rRNA基因及ITS1序列的系统学分析. 2006.