五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析

IOCAS-IR

	五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析
	王波 ; 米铁柱 ; 吕颂辉 ; 孙军 ; 李秀芹 ; 甄毓 ; 李荣秀 ; 于志刚
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2006-09-30
出版年	2006
期号	05 页码:68-74
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	采用分子克隆及序列比对的方法,对五种/株赤潮原甲藻18SrRNA基因全长序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GenBank上下载13个原甲藻18SrRNA基因接近全长的序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树。结果表明,五种/株原甲藻18SrRNA基因扩增序列长度为1782—1783bp,其中来自南海(中国海域)和来自美国海域的两株微小原甲藻(Prorocentrumminimum)的序列完全一致;东海的赤潮原甲藻(Prorocentrumsp·)与具齿原甲藻(P·dentatum)的序列也完全一致,与微小原甲藻只有5个碱基的差异;而海洋原甲藻(P·micans)与微小原甲藻和具齿原甲藻的序列差异较大,分别为27个和28个碱基。通过NJ法和ME法构建的系统树基本一致。由系统树可以看到:原甲藻属大致分为两支,本实验的微藻全部分布在同一支上。18SrRNA基因序列还将有助于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针的研制。
关键词	原甲藻属 18S rRNA基因系统分析
CNKI专辑号	A;B;
CNKI专辑名称	基础科学;工程科技Ⅰ辑;
CNKI专题号	B027;A006;A006;
CNKI专题名称	环境科学与资源利用;生物学;生物学;
分类号	X173;Q943.2
收录类别	北大核心 ; 中科院核心
语种	中文;
资助项目(基金）	国家高技术研究发展计划(863计划)项目,2001AA635090号 ; 国家重点基础研究发展规划(973)项目,2001CB409704号 ; 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金,01BS08号
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/198531
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国海洋大学 2.暨南大学水生生物研究所 3.中国科学院海洋研究所 4.上海交通大学 5.暨南大学水生生物研究所青岛266003 6.青岛266003 7.广州510632 8.青岛266071 9.上海200030
推荐引用方式 GB/T 7714	王波,米铁柱,吕颂辉,等. 五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析. 2006.