日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育

IOCAS-IR

	日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育
	申欣 ; 李晓 ; 沙忠利; 阎斌伦 ; 徐启华
发表期刊	中国科学:生命科学
ISSN	1674-7232
	2012-07-20
出版年	2012
卷号	v.42 期号:07 页码:83-90
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	在日本鼓虾线粒体基因组完成的基础上,结合现有线粒体基因组数据,全面揭示了真虾类线粒体基因组的基本特征.日本鼓虾线粒体基因组全长16487bp,包含37个基因,与后生动物线粒体基因组的标准基因组成一致.4个已完成的真虾类(罗氏沼虾、日本沼虾、沼虾Macrobrachium lanchesteri和夏威夷红虾)线粒体基因组的基因排列与泛甲壳动物的原始排列完全相同,过去曾经认为在真虾下目线粒体基因组中没有基因重排现象.然而,鼓虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnE)的易位和反转,这种基因排列方式在其他甲壳动物线粒体基因组中未见报道.同时,脊尾白虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnP或trnT)的易位.分别统计了2种鼓虾(日本鼓虾和鲜明鼓虾)和3种沼虾(罗氏沼虾、日本沼虾和沼虾M.lanchesteri)13个蛋白质编码基因(PCGs)非同义替换与同义替换的比值(Ka/Ks),发现鼓虾和沼虾所有线粒体蛋白质编码基因的Ka/Ks均小于1,显示出强烈的纯化选择.基于线粒体基因组的系统发育分析结果,强烈支持长臂虾科和鼓虾科为单系群,并且其在科级的亲缘关系为:(长臂虾科+鼓虾科)+匙指虾科(BPM=100,BPP=100).
关键词	十足目真虾下目线粒体基因组基因排列系统发育
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心
语种	中文;
资助项目(基金）	国家自然科学基金(批准号:40906067和31172054) ; 中央财政支持地方高校发展专项基金(CXTD04) ; 中国博士后科学基金(批准号:2012M510054) ; 江苏省海洋生物技术重点实验室基金(批准号:2009HS12和2009HS13) ; 青蓝工程人才基金(批准号:苏教师[2010]27)资助项目
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/191178
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室 2.中国科学院海洋研究所 3.山东省花生研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	申欣,李晓,沙忠利,等. 日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育. 2012.