基于mtCOI片段序列的南极海域浮游动物DNA条形码研究

doi:10.13679/j.jdyj.2014.2.212

IOCAS-IR

	基于mtCOI片段序列的南极海域浮游动物DNA条形码研究
	程方平 ; 王敏晓 ; 孙松 ; 李超伦; 张永山
发表期刊	极地研究
ISSN	1007-7073
	2014-06-15
出版年	2014
卷号	v.26 期号:02 页码:40-49
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	极地海区浮游动物对全球气候变化的响应极其敏感,其群落结构已成为研究全球变化对海洋生态系统影响的重要指标,而DNA条形码则是浮游动物种类鉴定的有效工具。采用线粒体细胞色素c氧化酶第一亚基编码基因(mtCOI)特异扩增测序的方法,分析了南大洋32种常见浮游动物的94条DNA条形码序列,其长度分布在830碱基到1050碱基之间。发现南极常见浮游动物种内遗传差异均值为0.67%,分布在0—2.6%之间;同属近源种间遗传差异均值为14.3%,分布在0.1%—29.3%之间。哲水蚤属的近缘哲水蚤(Calanus propinquus)和C.simillimus遗传相似度非常高。考虑到上述两者在形态和遗传上的相似性,本研究认为两种可能为同种异名,有待开展深入研究确认C.simillimus种的地位。除了哲水蚤属的两种外,所有样品种内、种间遗传差异显著,且同种的不同样品都聚到一起形成单系群。结果表明mtCOI序列可以作为DNA条形码实现南极浮游动物常见种的准确鉴定(水母和海樽等胶质浮游动物的有效性未验证)。以上结果也得到了示踪向量分析的证实。本研究新增的DNA条形码数据以及新提供的兼并引物必将推动南极浮游动物环境样品的宏基因组学研究。
关键词	南大洋 DNA条形码哲水蚤属浮游动物
CNKI专辑号	A;
CNKI专辑名称	基础科学;
CNKI专题号	A006;
CNKI专题名称	生物学;
分类号	Q958.8
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
DOI	10.13679/j.jdyj.2014.2.212
资助项目(基金）	中国极地科学战略研究基金项目(20100215,20120308) ; 南北极环境综合考察与评估专项(CHINARE2013-01-05) ; 中国科学院海洋所海洋生物多样性专项资助
引用统计
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190427
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室 2.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	程方平,王敏晓,孙松,等. 基于mtCOI片段序列的南极海域浮游动物DNA条形码研究. 2014.