基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发

IOCAS-IR

	基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发
	潘婷 ; 张岩 ; 张辉 ; 高天翔 ; 肖永双 ; 姜云荣
发表期刊	渔业科学进展
ISSN	1000-7075
	2015-02-15
出版年	2015
卷号	v.36 期号:01 页码:28-34
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	利用Roche 454 GS FLX平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选,并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析,得到247种多态性位点,其中完美型占52.22%,非完美型占20.24%,复合型占27.54%,(AC)n、(AG)n两碱基重复类型的比例是44%,重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物,采用5个野生个体,利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价,4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,不同位点得到的等位基因范围为3-8,平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明,454 GS FLX提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。
关键词	Roche 454 GS FLX 钝吻黄盖鲽开发微卫星标记
CNKI专辑号	D;
CNKI专辑名称	农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家科技基础条件平台项目(2006DKA30470-006)资助
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/190135
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.上海海洋大学水产与生命学院 2.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 3.中国科学院海洋研究所 4.中国海洋大学水产学院
推荐引用方式 GB/T 7714	潘婷,张岩,张辉,等. 基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发. 2015.