玻璃质壳类底栖有孔虫卷转虫属Ammonia spp.的DNA保存方式和提取效能比较研究

IOCAS-IR

	玻璃质壳类底栖有孔虫卷转虫属Ammonia spp.的DNA保存方式和提取效能比较研究
	吕曼 ; 类彦立; 李铁刚
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2016-03-15
出版年	2016
卷号	v.47 期号:02 页码:57-64
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	对有孔虫的DNA进行有效保存及提取是开展有孔虫分子鉴定工作的前提。本研究以探索适合玻璃质壳类底栖有孔虫的DNA保存及提取方法为目的,以中国近海优势属——玻璃质类底栖有孔虫卷转虫属(Ammonia spp.)为模式生物,考察不同温度(20—120°C,间隔10°C)烘干、冷冻(–20°C、–80°C,有水、无水)以及脱氧胆酸钠裂解液(Na deoxycholate,简称DOC)处理(含和不含EDTA)保存有孔虫DNA方法,同时进行了DOC裂解液法和Guanidine裂解液法对Ammonia spp.DNA提取效能的比较。结果显示,烘干保存法中20°C组和30°C组显著优于40°C组(P<0.05);冷冻保存法中无水组显著优于有水组(P<0.05);DOC裂解液保存法各组间无显著差异(P>0.05)。三种保存方法综合效果表现为冷冻组显著优于烘干组和裂解液组(P<0.05);两种DNA提取方法的提取效果都很好,但DOC法更廉价且操作简便。本文给出了一套适用于玻璃质壳类有孔虫的DNA保存和提取的优化方案。
关键词	玻璃质壳底栖有孔虫分子生物学 Ammonia DNA提取保存
CNKI专辑号	A;
CNKI专辑名称	基础科学;
CNKI专题号	A006;
CNKI专题名称	生物学;
分类号	Q953
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家自然科学基金项目,41476043号,41230959号,41176132号 ; 中国科学院战略性先导科技专项(A类)项目,XDA11030104号 ; 大陆架科学钻探项目,GZH201100202号 ; 国家海洋局全球变化与海气相互作用专项项目,GASI-03-01-03-01号,DOMEP(MEA)-01-01-E号 ; 中华人民共和国科学技术部项目,2014FY110500号
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/189749
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室 2.中国科学院大学 3.国家海洋局第一海洋研究所海洋沉积与环境地质国家海洋局重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋地质过程与环境功能实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	吕曼,类彦立,李铁刚. 玻璃质壳类底栖有孔虫卷转虫属Ammonia spp.的DNA保存方式和提取效能比较研究. 2016.