基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析

IOCAS-IR

	基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析
	刘乾 ; 米铁柱 ; 甄毓 ; 王华龙 ; 于志刚
发表期刊	科学通报
ISSN	0023-074X
	2016-08-10
出版年	2016
卷号	v.61 期号:22 页码:61-71
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	以玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组信息为基础,分析了其碳固定代谢途径,共发现18种酶对应的34个编码基因,构建了玛氏骨条藻进行碳固定代谢途径的通路图.这些编码基因的序列比对结果表明,其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源基因具有较高的一致性.对这些样品进行数字基因表达谱的差异基因分析,获得了不同生长时期碳固定代谢途径酶编码基因的差异表达情况.通过分析发现,C3和C4代谢途径中存在表达差异的基因分别有7和3个,其中果糖-1,6-二磷酸酶和丙酮酸磷酸双激酶的编码基因表达在指数生长期之后出现显著上调.这有助于对玛氏骨条藻碳固定代谢途径中关键编码基因调控过程的解析,为进一步研究硅藻的固碳机制奠定了基础,也为深入了解碳的生物地球化循环提供了新的研究方向.
关键词	玛氏骨条藻碳固定代谢途径转录组
CNKI专辑号	A;
CNKI专辑名称	基础科学;
CNKI专题号	A006;
CNKI专题名称	生物学;
分类号	Q943.2
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	海洋公益性行业科研专项(201205031) ; 国家自然科学基金(41521064) ; 山东省自然科学基金(ZR2014DM007)资助
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/189585
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国海洋大学海洋生命学院 2.中国海洋大学海洋环境与生态教育部重点实验室 3.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室 4.中国海洋大学环境科学与工程学院 5.中国海洋大学海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	刘乾,米铁柱,甄毓,等. 基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析. 2016.