11种鲈形目鱼类ITS2特征及系统应用

IOCAS-IR

	11种鲈形目鱼类ITS2特征及系统应用
	武宝生 ; 司李真 ; 孔晓瑜 ; 时伟 ; 龚理 ; 杨敏 ; 刘静
发表期刊	中国水产科学
ISSN	1005-8737
	2018-11-15
出版年	2018
卷号	v.25 期号:06 页码:4-13
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	ITS2 (Internal transcribed spacer 2)是位于核糖体5.8S和28S基因之间的非编码序列。为了探讨该片段的多样性特征以及进化模式,本研究选取了鲈形目(Perciformes) 5科11种鱼类为研究对象,共获得了444条ITS2克隆序列,其长度范围为332～515 bp。比较种内不同序列的长度发现,金带细鲹(Selaroides leptolepis)在种内存在24 bp的差异,剑鱼(Xiphias gladius)在种内存在32 bp的差异,这2种鱼类的差异较为明显;其余9种鱼类的长度相对比较保守,长度差异小于14 bp。依据11种鱼类的保守位点数、变异位点数、简约信息位点数、单倍型数、保守位点比例、单倍型多样性指数、核苷酸多样性等特征分析发现,种内存在着不同程度差异,特别是金带细鲹的ITS2序列存在着Type A、Type B和Type C 3种类型,各类型间差异较大。根据序列的多样性特征推断,金带细鲹和剑鱼的进化方式为非协同进化;蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)、大甲鲹(Megalaspis cordyla)、吉打副叶鲹(Alepes djedaba)和日本竹筴鱼(Trachurus japonicas)的长度和变异位点均存在着一定程度的差异,但差异并不明显,视为不严格的协同进化;泰拉鰆鲹(Scomberoides tala)、布氏鲳鲹(Trachinotus blochii)、尖吻鲈(Lates calcarifer)、射水鱼(Toxotes chatareus)和军曹鱼(Rachycentron canadum) 5种鱼类为协同进化;另外,协同和非协同进化状态与分类系统没有相关性。序列比对发现,大甲鲹种内存在着由协同进化方式演变为非严格的协同进化方式的过度序列;在金带细鲹的3个不同个体中,序列间存在着从协同进化、非严格的协同进化演变为非协同进化的3种进化方式。基于ITS2序列构建的11种鱼类的邻接系统树显示,每种鱼类的克隆都分别按种单独聚为一支,鲹科7属鱼类各属也是单独聚支,表明ITS2不仅可以用在种类的分子鉴定,同时也可以作为分子标记应用于鲹科和属级水平的系统关系研究。
关键词	多态性协同进化非协同进化系统关系 ITS2 鲈形目
CNKI专辑号	D;
CNKI专辑名称	农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家自然科学基金项目(31272273)
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/188715
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 2.中国科学院大学 3.广东省应用海洋生物学重点实验室 4.中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	武宝生,司李真,孔晓瑜,等. 11种鲈形目鱼类ITS2特征及系统应用. 2018.