海洋线虫Litoditis marina早期发育的转录组分析

IOCAS-IR

	海洋线虫Litoditis marina早期发育的转录组分析
	王彤彤; 张留所
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2022-11-15
出版年	2022
卷号	v.53 期号:06 页码:264-278
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	全球气候和环境变化影响海洋动物的生长发育和繁殖等生命过程,探究环境因子调控发育的分子机制,需要深入了解海洋动物早期发育的生理和分子特征。以实验室驯化的潜在模式动物海洋线虫Litoditis marina为研究对象,对其胚胎期和孵化后发育早期2 h、4 h和6 h的L1幼虫样品进行了转录组测序和分析。结果表明, 2 h、4 h和6 h的L1幼虫间差异较小,而三个L1幼虫样品与胚胎期相比,基因表达发生了显著变化。通过KEGG富集分析,发现与胚胎期相比,三个L1幼虫样品的多个通路如核糖体、核糖体生物发生、糖酵解/糖原异生、TCA循环和氧化磷酸化通路相关基因发生了显著上调。另外还发现多个神经递质和神经肽受体基因如dop-和npr-等在L1期转录水平显著上调。与胚胎期相比, L1幼虫的多个DNA复制和修复相关、Notch、Hippo和Hedgehog信号和剪切体等通路相关基因发生了显著下调。发现的L. marina早期发育转录组变化模式与已经发表的陆生模式生物秀丽线虫Caenorhabditis elegans从胚胎期到L1幼虫的转录组变化特征非常相似,但同一上调或下调通路中具体发生表达变化的基因有些不同。另外, L1幼虫显著上调的核糖体生物发生通路相关基因在秀丽线虫中发生了显著下调。进一步通过基因编辑等技术和方法深入研究发育调控关键基因的功能将为海陆近缘线虫间的发育进化机制、海洋线虫对潮间带环境适应以及全球气候变化应答的分子机制研究提供新认知。
关键词	海洋线虫 Litoditis marina 早期发育核糖体能量代谢神经受体 DNA复制和修复
CNKI专辑号	A;
CNKI专辑名称	基础科学;
CNKI专题号	A006;
CNKI专题名称	生物学;
分类号	Q953
收录类别	北大核心 ; 中科院核心 ; 中科院扩展
语种	中文;
资助项目(基金）	国家重点研发项目,2018YFD0901301号 ; 青岛创业创新领军人才项目,Grant 16-8-3-19-zhc号 ; 中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目,2019.11~2022.11
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/187274
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所中国科学院实验海洋生物学重点实验室 2.青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 3.中国科学院海洋大科学研究中心 4.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	王彤彤,张留所. 海洋线虫Litoditis marina早期发育的转录组分析. 2022.