基于RNA-seq数据分析长牡蛎(Crassostrea gigas)天然免疫的可变剪接事件

IOCAS-IR

	基于RNA-seq数据分析长牡蛎(Crassostrea gigas)天然免疫的可变剪接事件
	李若晖 ; 张琳琳
发表期刊	海洋与湖沼
ISSN	0029-814X
	2024-01-30
出版年	2024
卷号	v.55 期号:01 页码:186-196
文献类型	CNKI期刊论文
摘要	大部分无脊椎动物缺乏基于经典抗体和记忆细胞的适应性免疫,因而天然免疫在无脊椎动物免疫防御中发挥不可或缺的作用。可变剪接正是产生天然免疫多样性和特异性的重要途径。牡蛎(Crassostrea)是全球范围内的大宗养殖贝类和我国产量最高的海水养殖贝类,理解其天然免疫系统的多样性和特异性对牡蛎病害防治和养殖业健康可持续发展至关重要。通过对不同病原诱导以及诱导后不同时间的转录组进行生物信息分析,系统地研究了长牡蛎天然免疫应激反应的可变剪接事件。发现在弧菌诱导下可变剪接事件的总数显著增加,表明弧菌的感染会诱导长牡蛎可变剪接事件的产生。对病原诱导后可变剪接体的组成类型及表达量显著变化的基因的功能富集分析,表明免疫系统相关功能被显著富集,病原感染不同阶段以及不同病原感染后可变剪接体的组成类型和表达量均不一致,表明长牡蛎免疫系统可通过可变剪接产生免疫响应的特异性和多样性。研究结果为长牡蛎等无脊椎动物天然免疫多样性和特异性提供了典型实例,也为长牡蛎病害防御提供了理论支撑。
关键词	长牡蛎可变剪接病原体诱导天然免疫
CNKI专辑号	A;D;
CNKI专辑名称	基础科学;农业科技;
CNKI专题号	D052;
CNKI专题名称	水产和渔业;
分类号	S917.4
收录类别	北大核心
语种	中文;
资助项目(基金）	国家重点研发计划,2022YFD2401400号 ; 中国科学院战略性先导科技专项,XDB42000000号 ; 国家自然科学基金,41976088号
文献类型	CNKI期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/186913
专题	中国科学院海洋研究所
作者单位	1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室 2.青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 3.中国科学院大学
推荐引用方式 GB/T 7714	李若晖,张琳琳. 基于RNA-seq数据分析长牡蛎(Crassostrea gigas)天然免疫的可变剪接事件. 2024.