不同养殖海藻表面附着细菌多样性分析

	不同养殖海藻表面附着细菌多样性分析
	武洪庆
学位类型	博士
导师	肖天
	2012-05
学位授予单位	中国科学院研究生院
学位专业	海洋生物学
关键词	大型海藻附着细菌多样性 16s Rdna克隆文库
摘要	大型海藻的表面附着着大量的细菌，这些细菌对于藻的生长发育和形态发生必不可少，某些菌株在特定条件下还可以导致藻类疾病的发生。藻类表面附着细菌群落多样性研究是了解海藻和附着细菌相互关系的必要前提。本论文应用分离培养方法和分子生物学技术对中国沿海不同海域不同养殖海藻表面的附着细菌进行了分析研究。从不同地点采集7种海藻（条斑紫菜、坛紫菜、龙须菜、细基江篱、异枝麒麟菜、浒苔、蜈蚣藻）的22个样品上分离培养，获得了606个菌株，通过鉴定它们主要分布于4个门的35个属内。其中变形菌门的菌株最多，占总分离菌数的84.48%，其后依次为拟杆菌门7.43%、厚壁菌门7.10%、放线菌门0.99%。变形菌门的γ-变形菌纲中菌株最多（占总菌株的84.16%），有16个属，以Pseudoalteromonas（假交替单胞菌属）菌株最多，占总分离菌数的54.29%。其它是Acinetobacter（不动杆菌属）、Alteromonas（交替单胞菌属）、Amphritea、Cobetia、Colwellia、Escherichia（埃希氏菌属）、Halomonas、Marinomonas、Photobacterium（发光杆菌属）、Pseudoalteromonas、Pseudomonas（假单胞菌属）、Psychrobacter、Psychromonas、Shewanella（希瓦氏菌属）、Stenotrophomonas、Vibrio（弧菌属）；α-变形菌纲2个属，是Brevundimonas和Pseudoruegeria。在拟杆菌门发现了10个属，分别为Algibacter、Cellulophaga（食纤维素属）、Maribacter、Olleya、Persicivirga、Polaribacter、Psychroserpens、Tenacibaculum、Winogradskyella、Zobellia。厚壁菌门有5个属，分别为Bacillus（芽孢杆菌属）、Desemzia、Jeotgalicoccus、Salinicoccus（盐水球菌属）、Staphylococcus（葡萄球菌属）。放线菌门有2个属，分别为Microbacterium（微杆菌属）、Micrococcus（微球菌属）。同海区来源的同品种海藻间，分离获得可培养菌株，在优势种属和多样性上都有较明显差异。条斑紫菜各不同来源海区样品分离菌株之间，不仅种类组成差异明显，优势菌株也各不相同，分别为Pseudoalteromonas、Bacillus、Maribacter和Photobacterium。坛紫菜、龙须菜、细基江篱三种海藻各自不同的样品之间，分离菌株在种类组成及数量上有明显差异，但每个样品的优势菌株均属Pseudoalteromonas。异枝麒麟菜的两个样品分离菌株的种类组成较为相似，并且优势菌株均为Pseudoalteromonas。浒苔上分离的菌株较少，但两个样品分离菌株之间差异较大，仅有一个相同属，是Pseudomonas。蜈蚣藻样品仅一个样品，分离菌株全部为Pseudoalteromonas。不同种类海藻之间比较的结果表明，Pseudoalteromonas在每种海藻中均有发现，并且除了条斑紫菜以及浒苔的个别样品外，均为优势菌株。另外的优势种类是Vibrio、Pseudomonas和Staphylococcus。Vibrio在除了蜈蚣藻之外的6种藻类样品上均分离；Pseudomonas 在条斑紫菜、坛紫菜、龙须菜、细基江篱和浒苔5种藻上均有发现；Staphylococcus在条斑紫菜、坛紫菜、龙须菜、细基江篱、异枝麒麟菜5种藻上均有发现。不同海藻样品分离菌株组成的比较以及聚类分析和非线性多维标度分析结果表明，藻种差异和地区差异以及可能存在的其它因素共同影响着分离菌株的组成，仅在少数样品之间呈现出较强的同地区相似性或同种藻相似性。对采集自大连的7种海藻（条斑紫菜、马泽藻、海萝、龙须菜、孔石莼、裙带菜、海带）构建了表面附着细菌的克隆文库，并对克隆文库进行了多样性及系统发育分析。条斑紫菜表面附着细菌构建的克隆文库主要由Ahrensia、Octadecabacter、Roseobacter、Sulfitobacter、Cocleimonas、Moritella、Psychromonas、Formosa、Olleya、Winogradskyella 10个属组成，其中以Olleya占优势，约27.87%。马泽藻表面附着细菌的克隆文库主要由13个属组成，分别为Loktanella、Pseudoruegeria、Robiginitomaculum、Roseovarius、Sulfitobacter、Aliivibrio、Colwellia、Leucothrix、Oleispira、Pseudoalteromonas、Psychrobacter、Psychromonas、Polaribacter，其中以Leucothrix居多，占14.81%。海萝表面附着细菌克隆文库主要包括8个属，分别为Octadecabacter、Roseovarius、Sulfitobacter、Alteromonas、Leucothrix、Marinomonas、Pseudoalteromonas、Lacinutrix，其中以Pseudoalteromonas最多，总共42.37%。龙须菜表面附着细菌克隆文库由Alteromonas、Colwellia、Oceanisphaera、Photobacterium、Pseudoalteromonas、Psychrobacter、Psychromonas、Vibrio 8个属组成，其中以Pseudoalteromonas最多，占67.86%。孔石莼表面附着细菌克隆文库主要包括Altererythrobacter、Bradyrhizobium、Erythrobacter、Octadecabacter、Roseovarius、Sulfitobacter、Psychromonas、Winogradskyella和Bacillus 9个属，其中Octadecabacter最多，占28%。裙带菜表面附着细菌克隆文库主要包括Loktanella、Alteromonas、Colwellia、Granulosicoccus、Leucothrix、Moritella、Oceanisphaera、Pseudoalteromonas、Psychrobacter、Psychromonas、Rheinheimera、Bizionia、Lacinutrix、Polaribacter，计14个属，其中Leucothrix占了46%。海带表面附着细菌克隆文库仅包括三个属Pseudoalteromonas、Psychromonas、Vibrio，其中Psychromonas最多，占91.67%。在获得的所有克隆文库中均以变形菌门（主要为α-变形菌纲和γ-变形菌纲）为主，其次为拟杆菌门。从属的水平进行比较，7个克隆文库总共发现了34个属。其中条斑紫菜克隆文库中Ahrensia、Roseobacter、Cocleimonas、Formosa和Winogradskyella 5个属为特有属。马泽藻表面附着细菌克隆文库中Pseudoruegeria、Robiginitomaculum、Aliivibrio、Oleispira为特有属。海萝表面附着细菌克隆文库中仅Photobacterium为特有属。龙须菜表面附着细菌克隆文库中仅Marinomonas为特有属。孔石莼表面附着细菌克隆文库中Altererythrobacter、Bradyrhizobium、Erythrobacter和Bacillus 4个属为特有属。裙带菜表面附着细菌克隆文库中Granulosicoccus、Rheinheimera和Bizionia为特有属。其余各属中，Psychromonas分布较广，在6个海藻克隆文库中均有发现（龙须菜中未发现），其它各属仅发现于少数几个克隆文库。各海藻样品表面附着细菌构建的克隆文库均有较为明显的优势属存在。其中龙须菜和海萝克隆文库中具有相同优势属，裙带菜和马泽藻克隆文库具有相同优势属，条斑紫菜、孔石莼、海带克隆文库各自具有特有的优势属。在属的水平上进行的聚类分析表明，大连7个海藻样品表面附着细菌的克隆文库分为3类：绿藻门孔石莼、红藻门龙须菜和条斑紫菜聚为一类，红藻门马泽藻、海萝和褐藻门裙带菜聚为一类，海带单独归为一类。非线性多维标度分析的结果和聚类分析结果一致，并且显示出绿藻门、红藻门、褐藻门之间较为明显的差异。
语种	中文
文献类型	学位论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/17861
专题	海洋生态与环境科学重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	武洪庆. 不同养殖海藻表面附着细菌多样性分析[D]. 中国科学院研究生院,2012.

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不同养殖海藻表面附着细菌多样性分析-武洪（5257KB）			限制开放	CC BY-NC-SA	浏览