Institutional Repository of Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences
| 基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析 | |
隗健凯 ; 柳承璋; 张晓军; 王兵; 董波; 李富花; 相建海
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| 2013-05-15 | |
| 发表期刊 | 水产学报
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| 期号 | 5页码:661-671 |
| 摘要 | 对前期获得的中国明对虾头胸部、血液、眼柄、卵巢4种组织的EST测序数据进行了生物信息学挖掘和分析。4种组织的原始EST序列分别为10 446条、2 690条、1 067条和1 282条,通过聚类拼接得到unigene 3 454条、1 053条、406条和544条,对其进行了NR、GO、KEGG等数据库的功能注释,并在此基础上进行了组织差异分析。通过同源比对的方法找出了各组织特异的转录本,并根据注释信息将其进行了GO功能分类。结果显示,血液组在细胞杀伤、迁移和节律等功能分类上特异性富集;眼柄组在色素生成、信号传递和生物学调控等功能分类上特异性富集;卵巢组在营养贮存运输、繁殖和定位等功能分类上特... |
| 关键词 | 中国明对虾 表达序列标签(Est) 组织差异 组织高表达基因 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/16830 |
| 专题 | 实验海洋生物学重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 隗健凯,柳承璋,张晓军,等. 基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析[J]. 水产学报,2013(5):661-671. |
| APA | 隗健凯.,柳承璋.,张晓军.,王兵.,董波.,...&相建海.(2013).基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析.水产学报(5),661-671. |
| MLA | 隗健凯,et al."基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析".水产学报 .5(2013):661-671. |
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| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表（788KB） | 限制开放 | CC BY-NC-SA | 浏览 | |||
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