Institutional Repository of Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences
| 凡纳滨对虾大量EST的生物信息学分析 | |
孙政; 柳承璋; 李富花; 张晓军; 张俊彬; 相建海
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| 2013-09-15 | |
| 发表期刊 | 海洋学报(中文版)
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| 期号 | 5页码:128-136 |
| 摘要 | 凡纳滨对虾是我国乃至世界最重要的对虾养殖种。EST(expressed sequence tags)测序是对没有基因组背景的生物进行功能基因分析最为有效的方法之一。为了研究凡纳滨对虾重要功能基因、以及为筛选分子标记奠定基础,本文集成了一套快速高效的EST信息深度挖掘的方法,并对公共数据库中161 241条凡纳滨对虾EST序列进行分析,获得了20 410条unigenes,包括14 236条contigs和6 174条singlets。通过与NR数据库比对发现有注释的基因7 984条,并对其余12 426条未知基因中的4 702条进行了功能域注释。对有NR注释的基因的GO分类分析获得其中2 71... |
| 关键词 | 凡纳滨对虾 Est 基因组织特异性表达 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/16817 |
| 专题 | 实验海洋生物学重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 孙政,柳承璋,李富花,等. 凡纳滨对虾大量EST的生物信息学分析[J]. 海洋学报(中文版),2013(5):128-136. |
| APA | 孙政,柳承璋,李富花,张晓军,张俊彬,&相建海.(2013).凡纳滨对虾大量EST的生物信息学分析.海洋学报(中文版)(5),128-136. |
| MLA | 孙政,et al."凡纳滨对虾大量EST的生物信息学分析".海洋学报(中文版) .5(2013):128-136. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 凡纳滨对虾大量EST的生物信息学分析.p（658KB） | 限制开放 | CC BY-NC-SA | 浏览 | |||
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