Institutional Repository of Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences
| 长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析 | |
| 刘福利; 王飞久; 邵展茹 | |
| 2012 | |
| 发表期刊 | 海洋科学进展
 |
| 期号 | 4页码:587-594 |
| 摘要 | 长囊水云(Ectocarpus siliculosus)是一种重要的海洋褐藻,是褐藻研究的模式生物。以其叶绿体全基因组序列为基础,对密码子使用特征进行分析。结果显示,叶绿体基因组的GC尤其是GC3值较低,分别为31.8%和17.32%,偏向使用以A或T碱基结尾的密码子;全基因组具有较小的有效密码子数(ENC)值和较高的密码子适应指数(CAI)值,表明其具有较高的同义密码子使用偏性;密码子使用特征受到基因表达水平上的自然选择以及基因碱基组成中性突变的双重影响,其中选择的作用对高表达基因密码子使用偏性的影响比较突出,而突变是低表达基因密码子使用偏性的主要影响因素。另外,首次确定UUU,GUU,UC... |
| 关键词 | 长囊水云 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 |
| 语种 | 中文 |
| 文献类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/12946 |
| 专题 | 实验海洋生物学重点实验室 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘福利,王飞久,邵展茹. 长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析[J]. 海洋科学进展,2012(4):587-594. |
| APA | 刘福利,王飞久,&邵展茹.(2012).长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析.海洋科学进展(4),587-594. |
| MLA | 刘福利,et al."长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析".海洋科学进展 .4(2012):587-594. |
| 条目包含的文件 | ||||||
| 文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
| 长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析.（370KB） | 限制开放 | 使用许可 | 浏览 | |||
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