青蟹属的系统进化和中国沿海拟穴青蟹的群体遗传结构研究

IOCAS-IR > 海洋环流与波动重点实验室

	青蟹属的系统进化和中国沿海拟穴青蟹的群体遗传结构研究
其他题名	The Phylogeny of Genus Scylla and population genetic structure of Mud Crabs along coast of China
	路心平
学位类型	博士
	2008-06-06
学位授予单位	中国科学院海洋研究所
学位授予地点	海洋研究所
关键词	青蟹 12s Rrna基因 16s Rrna基因细胞色素氧化酶亚基i（coi）系统进化群体遗传结构
摘要	为了进一步研究青蟹属系统进化的科学问题，并揭示我国东南沿海青蟹群体遗传结构和群体进化细节信息，本论文主要开展了以下两个方面的研究：（1）基于线粒体12S rRNA、16S rRNA和COI三种基因序列探讨中国东南沿海青蟹的种类归属与青蟹属的系统进化；（2）利用线粒体COI基因标记分析中国东南沿海拟穴青蟹的群体遗传结构。序列特征、遗传距离和系统进化分析结果都表明本文研究的青蟹均为S. paramamosain。NJ、BAYES和ML系统进化树显示S. paramamosain与S. tranquebarica互为姐妹种，S. olivecea应该是4种青蟹中最早分化出来的种类。10个地理群体130只拟穴青蟹的线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）细胞色素氧化酶亚基I（COI）基因序列Mantel检验结果显示群体间的遗传分化程度与地理距离没有显著的相关性。分子进化中性检验结果表明自然选择在分子进化过程中起了重要作用，并暗示该物种在最近经历了一个快速的群体爆发及扩张事件。
其他摘要	Although the identification of Mud Crabs has been studied by a number of scientists, the phylogeny of Genus Scylla and population genetic structure of Mud Crabs along coast of China is still a problem need to be figured out. This paper mainly contains two parts of study: (1)Sequence Analysis of Mitochondrial 12S rRNA、16S rRNA and COI Gene of Mud Crabs along coast of China and the phylogeny of Genus Scylla; (2) Population genetic structure of S. paramamosain collected from the coast of the Southeastern China based on mtDNA COI sequences. Genetic distance and phylogenetic analysis suggested that the samples should be S. paramamosain．The NJ、BAYES and ML trees show that S. olivacea is far from the other three species and S. tranquebarica is closely related to S. paramamosain. A total of 130 crabs from 10 representative localities along the coast of Southeastern China were collected and anglicized at the mtDNA level in this study. By using a Mantel test, we found no significant correlation between pairwise population FST values (estimated by haplotypic frequencies) and geographic distances, suggesting that a simple model of isolation by distance is not appropriate for our data. Tests of neutral evolution (Tajima’s D and Fu’s Fs) revealed the D statistic was negative with a significant deviation from mutation-drift equilibrium, and result of Fu’s Fs-test, which was devised specifically to detect population expansion is more sensitive to the presence of singletons in a sample, showed a highly significant value.
页数	60
语种	中文
文献类型	学位论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/1099
专题	海洋环流与波动重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	路心平. 青蟹属的系统进化和中国沿海拟穴青蟹的群体遗传结构研究[D]. 海洋研究所. 中国科学院海洋研究所,2008.

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